地球太空基地捕捉到一组神秘信号，科学家认为这些信号来自于宇宙中的其他文明。为了探索外星文明，船长“袁”驾驶星舰——深空号，带领全船93名船员和智能机器人“齐”前往宇宙，踏上星辰之旅。但不久之后，飞船神秘失踪了。五十年后，深空飞船突然出现在地球轨道附近，船上只剩下一名幸存的卧铺。她是船长从前的情人“尹”。载人航天部成立了临时委员会，对尹进行调查询问，“深空”的惊险经历才慢慢开始。