世界范围内爆发了对男性强奸的妖魔化，原因至今不明。世界人口锐减，人类的生存开始面临绝望。五年前，在东京秋叶原的帝国战争中，梅西没能保护好桃子。此后，梅西带着科学家柳里子研制的时光机回到了过去，并与改革者安妮进行了多次激烈的战斗，但即使她不断回到过去，仍未能拯救桃子。如果我们能改变过去发生的事情，我们也许能让世界恢复原状。也许还有一些拯救桃子和世界的希望，所以梅西决定再次回到过去…