U. C.0097期间，“拉普拉斯事件”争议结束后，两只独角兽被秘密封印，新炯党剩下的臂章也随之崩塌。就在人类逐渐从战争带来的阴影中走出来的时候，失踪两年的独角兽三号机凤凰突然出现了。凭借着颠覆世界秩序的力量，立刻引发了地球联邦军、吉翁臂章残部和欧欧商会三大势力的争夺和围猎，一场宇宙对决即将开始。