凭借肉眼看到“细菌”的能力，当年轻的Akiki Naoki和他的童年好友结城萤进入农业大学时，发生了一系列有趣的事情。通过直树和其他角色的互动，我们可以了解到很多关于细菌的事情，很多事情都是直树的特殊能力造成的。每一集动画的结尾都有一个“细菌剧场”。