甲骨文局男女特工穿越时空，对抗时空扰乱组织的阴谋。在此期间，他们与明东林书院的兄弟们发生了一系列爱恨交织的纠葛：小三爱上了古人，自己与组织断绝了联系，试图扭转此人悲惨的历史命运，却被困在一个谜题中；人性本寒，任务第一，但在执行任务的过程中受到兄弟们的影响，最终融入其中。他所取代的人物的历史命运的电影，以神谕局对历史的修改而告终，却给了历史上注定悲剧命运的人物一个血腥的开放式结局。